一种ATAC-seq测序数据的生物信息分析方法
基本信息
| 申请号 | CN201911070887.0 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN110838341B | 公开（公告）日 | 2021-05-18 |
| 申请公布号 | CN110838341B | 申请公布日 | 2021-05-18 |
| 分类号 | G16B20/00 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 夏昊强;周煌凯;高川;陶勇;罗玥;程祖福;邢燕;曾川川 | 申请（专利权）人 | 广发银行股份有限公司广州分行 |
| 代理机构 | 广州容大知识产权代理事务所（普通合伙） | 代理人 | 刘新年 |
| 地址 | 510000 广东省广州市广州国际生物岛螺旋三路6号第五层501、502单元 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供一种ATAC‑seq测序数据的生物信息分析方法，包括以下步骤：对ATAC‑seq测序数据进行分析与质控；将分析与质控后的数据与参考基因组进行比对分析；对单样本Peak进行检测与统计；组内一致性peak提取与分析；各处理组peak合并以及多样本聚类分析；各处理组间共有和特有peak分析；组间peak丰度差异分析。本发明围绕常规ATAC‑seq测序数据进行研究，构建了一个分析内容丰富的，能满足个性化需求的常规ATAC‑seq测序数据分析流程。分析结果揭示了全基因组范围内的染色质开放区域的序列信息，并且可以帮助科研工作者进一步探索找到或预测参与基因组开放性高低变化的转录因子。 |
