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一种蛋白质靶点结构优化方法及系统

基本信息

申请号 CN202110436053.8 申请日 -
公开（公告）号 CN113096725A 公开（公告）日 2021-07-09
申请公布号 CN113096725A 申请公布日 2021-07-09
分类号 G16B15/30（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分类 物理
发明人 汝啸;林子敬 申请（专利权）人 宿州神农量子科技有限公司
代理机构 北京高沃律师事务所 代理人 王爱涛
地址 235300安徽省宿州市高新区黄淮石墨烯展示馆南栋4楼4008室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种蛋白质靶点结构优化方法及系统。该方法包括：从蛋白质靶点数据库中提取靶点结构；所述靶点结构包括主链结构和多个侧链结构；所述主链结构固定；按照设定顺序依次对多个侧链结构的多个二面角进行三自由度旋转，并判断旋转后的侧链结构数量是否达到预设结构数量；若否，则继续进行三自由度旋转；若是，则对旋转后的侧链结构采用DFTB方法进行优化并截取；截取之后，对剩余二面角进行三自由度旋转，且每个二面角旋转一次就采用DFTB方法进行优化并截取，直至所有侧链结构的所有二面角全部搜索完成。本发明通过可靠的构象搜索方法与量子化学计算的结构优化，提供准确可靠的靶点结构。