基于BRCA1和BRCA2突变的乳腺癌患病风险评估算法

基本信息

申请号 CN201510364732.3 申请日 -
公开(公告)号 CN106295241A 公开(公告)日 2017-01-04
申请公布号 CN106295241A 申请公布日 2017-01-04
分类号 G06F19/12(2011.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 马婷婷;刘明明;张鹤;柳泽亮;蔡乐靖;徐飞;陈帼婧;屠勇军;陈贤丰 申请(专利权)人 杭州圣庭生物技术有限公司
代理机构 杭州赛科专利代理事务所(普通合伙) 代理人 杭州圣庭生物技术有限公司
地址 310018 浙江省杭州市杭州经济开发区6号大街452号2幢14层C1410
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及疾病风险评估算法领域,尤其是—乳腺癌患病风险评估算法。本发明公开了一种基于BRCA 1和BRCA 2突变的乳腺癌患病风险评估算法,包括以下步骤:1)高通量测序得到BRCA 1和BRCA 2序列;2)筛选出BRCA 1和BRCA 2序列中的高危突变位置;3)建立COX比例风险模型,剔除不显著因素;4)分析各个高危突变因素对个体患病风险的影响;5)重新建立最佳模型,估计模型参数;6)计算个体患乳腺癌的概率;7)预测未来n年内患乳腺癌的概率;考虑样本其他高危风险因素,计算家族相对风险,对上述预测的患病概率进行修正。本发明是根据中国人特异的乳腺癌致病相关突变库,定义BRCA 1和BRCA 2高危突变位置,设计算法,计算样本个体乳腺癌患病的绝对风险,并预测个体未来几年内患乳腺癌的概率。