一种利用IIB型限制性内切酶进行微生物群落鉴定的方法
基本信息
申请号 | CN201811467986.8 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN109584956A | 公开(公告)日 | 2019-04-05 |
申请公布号 | CN109584956A | 申请公布日 | 2019-04-05 |
分类号 | G16B20/00;G16B50/00 | 分类 | 物理 |
发明人 | 孙政;王师;黄适;包振民;王修评;吕佳;朱鹏飞;滕飞 | 申请(专利权)人 | 青岛欧易生物科技有限公司 |
代理机构 | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人 | 李冉 |
地址 | 266000 山东省青岛市崂山区株洲路20号海信创智谷A座第8层804房间 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种利用IIB型限制性内切酶进行微生物群落鉴定的方法,步骤如下:利用IIB型限制性内切酶对基因组DNA进行酶切;DNA酶切片段连接相应数目种类的接头,然后进行PCR扩增,扩增产物通过再次酶切扩增得到相应数目的DNA文库,将质检合格的DNA文库进行高通量测序;建立“微生物IIB酶切组”数据库,并找到针对物种在不同分类级上的特有序列,建立“微生物IIB酶切特有序列数据库”;对测序获得的序列数据进行质量控制,保留含有酶切特异性位点的25bp‑35bp的碱基片段。本发明的鉴定方法,既能保留宏基因组鸟枪测序优点,又能解决成本问题,且具备处理痕量DNA的能力。 |
