通过成组SNP位点检测高通量测序样本污染的方法

基本信息

申请号 CN202010061621.6 申请日 -
公开(公告)号 CN113136422A 公开(公告)日 2021-07-20
申请公布号 CN113136422A 申请公布日 2021-07-20
分类号 C12Q1/6869(2018.01)I;G16B20/20(2019.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 王学良;杨贵江;鲁梅梅;刘蕴奡 申请(专利权)人 北京圣谷同创科技发展有限公司
代理机构 北京华睿卓成知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 唐莉
地址 100000北京市海淀区北清路103号超然时代工业园3号楼1层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了通过成组SNP位点的突变情况检测测序样本是否被污染的方法,成组SNP位点是指一组或更多组成组SNP位点,每一组成组SNP位点包括2个或更多个SNP位点,同一组成组SNP位点中各SNP位点之间的距离使得它们的位点数据会出现在同一条测序reads上。检测一个样本的测序结果中每一条reads上成组SNP位点的基因型情况,如果存在于不同reads上的成组SNP位点的基因型不同,则可以判定该样本中存在污染。