计算基因型对表型额外贡献的方法及装置

基本信息

申请号 CN201710669992.0 申请日 -
公开(公告)号 CN107315922A 公开(公告)日 2017-11-03
申请公布号 CN107315922A 申请公布日 2017-11-03
分类号 G06F19/00(2011.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 朱天生;范嘉庚;刘艳波 申请(专利权)人 杭州祥音生物医药科技有限公司
代理机构 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 杭州祥音生物医药科技有限公司;杭州祥音医学检验实验室有限公司
地址 310000 浙江省杭州市西湖区翠苑街道翠苑二区18-2幢115室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了计算基因型对表型额外贡献的方法及装置,涉及生物信息学技术领域,其中,该计算基因型对表型额外贡献的方法包括:首先,通过权威文献及生物数据库获取基因多态性位点信息,其中,基因多态性位点信息包括表型、基因型、基因频率和OR值,之后,按照基因多态性位点信息对应的表型将物种细分为多个亚类,接着,根据基因频率和OR值计算每种亚类中各个基因型的平均贡献值,然后,对单个待测试物种进行基因多态性位点检测,获取待测试物种的特定基因型,最后,根据OR值和平均贡献值计算特定基因型的对表型额外贡献值,通过上述方法能够方便快捷的计算出基因型对表型的额外贡献。