一种ARMS-TaqManBlocker体系的Blocker设计和筛选方法
基本信息
申请号 | CN202011295178.5 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112375808A | 公开(公告)日 | 2021-02-19 |
申请公布号 | CN112375808A | 申请公布日 | 2021-02-19 |
分类号 | C12Q1/6811(2018.01)I; | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 杨芳梅;徐红梅 | 申请(专利权)人 | 合肥欧创基因生物科技有限公司 |
代理机构 | 合肥律众知识产权代理有限公司 | 代理人 | 赵娟 |
地址 | 230000安徽省合肥市高新区创新大道106号明珠产业园3#5层D区 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种ARMS‑TaqMan Blocker体系的Blocker设计和筛选方法,设计方法将Blocker设计在突变位点处,覆盖突变位点即可;Blocker与野生型模板完全匹配,完全匹配的Tm值高于ARMS引物与野生型模板匹配的Tm值,允许熔点差低于5℃;Blocker与突变型模板不完全匹配,不完全匹配的Tm值与ARMS引物跟突变型模板的Tm值一致或接近;Blocker的3’末端添加多个与模板不匹配的无关碱基;筛选方法为,按照上述Blocker设计原则设计3‑10条Blocker,使这些Blocker与突变型模板匹配的Tm值在ARMS引物跟突变型模板匹配的Tm值附近呈现逐步升高的梯度,然后经实时PCR验证梯度Blocker对体系灵敏度和特异性的影响,筛选出对灵敏度无影响且特异性最好的Blocker。本发明提供的Blocker设计和筛选方法降低成本的同时,提升了体系的特异性。 |
