一种ARMS-TaqManBlocker体系的Blocker设计和筛选方法

基本信息

申请号 CN202011295178.5 申请日 -
公开(公告)号 CN112375808A 公开(公告)日 2021-02-19
申请公布号 CN112375808A 申请公布日 2021-02-19
分类号 C12Q1/6811(2018.01)I; 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 杨芳梅;徐红梅 申请(专利权)人 合肥欧创基因生物科技有限公司
代理机构 合肥律众知识产权代理有限公司 代理人 赵娟
地址 230000安徽省合肥市高新区创新大道106号明珠产业园3#5层D区
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种ARMS‑TaqMan Blocker体系的Blocker设计和筛选方法,设计方法将Blocker设计在突变位点处,覆盖突变位点即可;Blocker与野生型模板完全匹配,完全匹配的Tm值高于ARMS引物与野生型模板匹配的Tm值,允许熔点差低于5℃;Blocker与突变型模板不完全匹配,不完全匹配的Tm值与ARMS引物跟突变型模板的Tm值一致或接近;Blocker的3’末端添加多个与模板不匹配的无关碱基;筛选方法为,按照上述Blocker设计原则设计3‑10条Blocker,使这些Blocker与突变型模板匹配的Tm值在ARMS引物跟突变型模板匹配的Tm值附近呈现逐步升高的梯度,然后经实时PCR验证梯度Blocker对体系灵敏度和特异性的影响,筛选出对灵敏度无影响且特异性最好的Blocker。本发明提供的Blocker设计和筛选方法降低成本的同时,提升了体系的特异性。