一种基于低深度WGS评估HRDscore的方法
基本信息
| 申请号 | CN202110716079.8 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113257346B | 公开（公告）日 | 2021-10-19 |
| 申请公布号 | CN113257346B | 申请公布日 | 2021-10-19 |
| 分类号 | G16B20/20（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 楼峰;刘凯;张萌萌;郭璟;孙宏;曹善柏 | 申请（专利权）人 | 北京橡鑫生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京维正专利代理有限公司 | 代理人 | 张瑞雪 |
| 地址 | 102600北京市大兴区北京经济技术开发区科创十三街18号院5号楼16层1601 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本申请属于基因检测技术领域，具体公开一种基于低深度WGS评估HRD score的方法，其包括：处理待测样本的低深度WGS下机数据；以及以下三个步骤中的任意一个或多个步骤：步骤一：建立基因组杂合性缺失LOH的计算方法，获得HRD‑LOH score；步骤二：建立端粒等位基因不平衡TAI的计算方法，获得HRD‑TAI score；和，步骤三：建立大片段迁移LST的计算方法，获得HRD‑LST score。本申请至少具有以下有益效果之一：本申请提供的基于低深度WGS评估HRD score的方法以低深度WGS测序形成的数据为基础进行分析，极大地降低了成本，有利于大规模的应用。 |
