基于超算互联网的RNA结构预测方法及系统
基本信息
申请号 | CN202210283254.3 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN114649052A | 公开(公告)日 | 2022-06-21 |
申请公布号 | CN114649052A | 申请公布日 | 2022-06-21 |
分类号 | G16B15/00(2019.01)I;G16B30/00(2019.01)I;G16B50/30(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 郭浩宇;杨超超;王嘉祥;王继彬;潘景山;郭猛 | 申请(专利权)人 | 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) |
代理机构 | 济南圣达知识产权代理有限公司 | 代理人 | - |
地址 | 250014山东省济南市历下区科院路19号 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了基于超算互联网的RNA结构预测方法及系统,包括:获取待预测的RNA序列;对待预测的RNA序列进行编辑;对编辑后的RNA序列,进行RNA二级结构预测,得到RNA二级结构预测结果;从RNA二级结构预测结果中进行文件提取,得到文件提取结果;基于RNA二级结构文件提取结果和待预测的RNA序列,进行RNA三级结构预测,得到RNA三级结构预测结果;比较RNA三级结构预测结果与参考结构之间的差异,通过多个指标对差异进行衡量,选择最优的预测结构作为最终结构;其中,对待预测的RNA序列进行编辑、进行RNA二级结构预测和进行RNA三级结构预测;均调度多个超算算力资源进行实现。 |
