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一种单体聚合酶定向进化识别不同启动子的模拟预测方法

基本信息

申请号 CN202111067042.3 申请日 -
公开（公告）号 CN113764039A 公开（公告）日 2021-12-07
申请公布号 CN113764039A 申请公布日 2021-12-07
分类号 G16B20/50（2019.01）I;G16B5/00（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分类 物理
发明人 鄂超;戴维江;谢潇;郭霞;杨天森;郑善喜 申请（专利权）人 核工业湖州勘测规划设计研究院股份有限公司
代理机构 北京高沃律师事务所 代理人 苏士莹
地址 313000浙江省湖州市凤凰路581号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种单体聚合酶定向进化识别不同启动子的模拟预测方法，涉及生命科学技术领域。本发明所述方法通过使用Hdcok对得到并通过结构比对与MD模拟筛选出最佳复合体模型、参照定向进化实验对复合体模型进行特定突变、每个结构执行1μs时长的全原子分子动力学模拟和对每段轨迹进行能量计算机氢键盐桥分析，得出进化路径的能量学和结构动力学细节。利用本发明所述方法，成功把一个噬菌体RNAP从识别其原始启动子切换到另一个启动子上。