一种提高宏基因组纳米孔测序数据菌种组装效率的方法

基本信息

申请号 CN202110927474.0 申请日 -
公开(公告)号 CN113611359A 公开(公告)日 2021-11-05
申请公布号 CN113611359A 申请公布日 2021-11-05
分类号 G16B20/20(2019.01)I 分类 物理
发明人 李振中;陈莉;李珊;戴岩;李诗濛;任用 申请(专利权)人 江苏先声医学诊断有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 210042江苏省南京市玄武区玄武大道699-18号28幢
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种通过降维聚类分群提高宏基因组测序数据菌种组装效率的方法,所述方法通过k‑mer频率或频数统计,在组装前进行降维预分群,能够显著提高宏基因组组装效率,组装时间至少减少一半以上,同时保证生信鉴定的有效性和准确性。