一种在单细胞水平上检测基因组上核小体排布的方法
基本信息
| 申请号 | CN201710206067.4 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN106987629B | 公开（公告）日 | 2021-01-15 |
| 申请公布号 | CN106987629B | 申请公布日 | 2021-01-15 |
| 分类号 | C12Q1/6869 | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 高绍荣;高亚威;刘晓雨;陈川;陈嘉瑜;陈珺 | 申请（专利权）人 | 上海捷易生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海沪慧律师事务所 | 代理人 | 上海捷易生物科技有限公司;上海市第一妇婴保健院 |
| 地址 | 201204 上海市浦东新区高科西路2699号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及一种在单细胞水平上检测基因组上核小体排布的方法，包括如下步骤：(1)裂解细胞，并用微球核酸酶处理基因组上的DNA片段；(2)将步骤(1)中酶切后的产物用蛋白酶处理，去掉DNA片段缠绕的组蛋白；(3)将步骤(2)中得到的DNA片段进行测序文库构建，并进行高通量测序；(4)对高通量测序的结果进行比对分析，并对测序结果的质量进行评估，包括在基因组上的覆盖度、片段长度分布、在转录起始位点和CTCF结合位点的核小体排布。本发明方法通过尽量减少DNA纯化次数来减少损失，提高文库构建效率，进而可以利用极少量的细胞甚至单个细胞在全基因组水平上检测细胞的核小体排布。 |
