一种拉链式可延伸探针在cfDNA文库构建中的应用

基本信息

申请号 CN201910094209.1 申请日 -
公开(公告)号 CN109797196A 公开(公告)日 2019-05-24
申请公布号 CN109797196A 申请公布日 2019-05-24
分类号 C12Q1/6806(2018.01)I; C40B50/06(2006.01)I; C12N15/01(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 余越美; 蔡万世; 孙永乐 申请(专利权)人 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
代理机构 北京汇知杰知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
地址 102206 北京市昌平区中关村生命科学园生命园路8号院一区6号楼507
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种使用拉链式可延伸探针的cfDNA文库构建方法,包括:获得拉链式探针,其3’端包括与目标DNA单链互补配对的15‑20个碱基,5’端包括颈环结构,所述颈环结构中互补配对的碱基数目为18‑50个,所述颈环结构的环部从5’‑3’方向包括A和U碱基;将DNA样品打断成片段,变性成单链DNA;所述拉链式探针与变性后的单链DNA进行连接反应,然后进行延伸并在延伸链的3’端加上A,形成末端封闭的双链DNA复合物;在进行剪切,形成平末端3’都带有A的双链DNA;将所述双链DNA与接头连接;对所述连接接头的双链DNA进行探针捕获;对所述捕获序列进行测序,获得捕获序列的测序结果。