一种单细胞RNA逆转录与文库构建的方法
基本信息
申请号 | CN201810019044.7 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN108103055B | 公开(公告)日 | 2021-05-28 |
申请公布号 | CN108103055B | 申请公布日 | 2021-05-28 |
分类号 | C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6806(2018.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12N15/10(2006.01)I | 分类 | - |
发明人 | 胡春旭;陆思嘉;任军 | 申请(专利权)人 | 上海亿康医学检验所有限公司 |
代理机构 | 北京市中咨律师事务所 | 代理人 | 张莉;黄革生 |
地址 | 215123 江苏省苏州市苏州工业园区星湖街218号生物纳米园B7楼201单元 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明属于转录组分析领域,涉及到一种快速进行单细胞RNA逆转录与文库构建的方法。本发明能在5‑6小时内,由1‑2000个细胞或10pg‑20ng经提取的真核生物总RNA为起始,扩增出20‑500ng高质量全长双链cDNA,并获得符合下游分析要求的高质量cDNA文库。此发明有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和基因组DNA的污染,表达定量分子标签可辅助基因表达量计算,同时在完整扩增RNA序列信息的同时该表达定量分子标签还可保留链来源信息。本发明可获得95%以上的逆转录与扩增建库成功率,cDNA文库可无缝衔接Illumina主流测序平台,下机数据(5M Reads)可检测到90%以上的基因表达,基因表达一致性超过90%,扩增无明显偏倚,且需要的样本投入量更少。 |
