一种单细胞RNA逆转录与文库构建的方法

基本信息

申请号 CN201810019044.7 申请日 -
公开(公告)号 CN108103055B 公开(公告)日 2021-05-28
申请公布号 CN108103055B 申请公布日 2021-05-28
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6806(2018.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12N15/10(2006.01)I 分类 -
发明人 胡春旭;陆思嘉;任军 申请(专利权)人 上海亿康医学检验所有限公司
代理机构 北京市中咨律师事务所 代理人 张莉;黄革生
地址 215123 江苏省苏州市苏州工业园区星湖街218号生物纳米园B7楼201单元
法律状态 -

摘要

摘要 本发明属于转录组分析领域,涉及到一种快速进行单细胞RNA逆转录与文库构建的方法。本发明能在5‑6小时内,由1‑2000个细胞或10pg‑20ng经提取的真核生物总RNA为起始,扩增出20‑500ng高质量全长双链cDNA,并获得符合下游分析要求的高质量cDNA文库。此发明有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和基因组DNA的污染,表达定量分子标签可辅助基因表达量计算,同时在完整扩增RNA序列信息的同时该表达定量分子标签还可保留链来源信息。本发明可获得95%以上的逆转录与扩增建库成功率,cDNA文库可无缝衔接Illumina主流测序平台,下机数据(5M Reads)可检测到90%以上的基因表达,基因表达一致性超过90%,扩增无明显偏倚,且需要的样本投入量更少。