小分子药物的细胞色素P450代谢位点预测方法
基本信息
| 申请号 | CN201910631539.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN110428875B | 公开（公告）日 | 2021-07-02 |
| 申请公布号 | CN110428875B | 申请公布日 | 2021-07-02 |
| 分类号 | G16C20/50;G16C20/70;G06N20/10;G06N3/04 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 陈萍;李远鹏;张佩宇;马健;温书豪;赖力鹏 | 申请（专利权）人 | 深圳晶泰科技有限公司 |
| 代理机构 | 深圳市科吉华烽知识产权事务所（普通合伙） | 代理人 | 胡玉 |
| 地址 | 518000 广东省深圳市福田区福保街道福保社区红柳道2号顺丰工业厂房3层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供一种小分子药物的细胞色素P450代谢位点预测方法，采用基于支持向量机分类器的机器学习模型WhichCyp，对小分子属于细胞色素P450酶亚型1A2,2C9,2C19,2D6及3A4中一种或几种亚型的底物进行预测；利用基于卷积神经网络的机器学习模型对相应亚型的细胞色素P450酶对小分子药物的代谢位点进行预测排序；对完整的细胞色素P450酶体系与完整的分子的热力学及动力学相互作用进行计算评估；对各个构象进行较高精度的MMGBSA计算，得到不同的小分子构象与细胞色素P450酶的结合能；利用收集到的小分子训练集对流程进行训练，直到预测准确率>80%为止。本发明提高了预测的准确性。 |
