向导RNA作用靶点的筛选方法、计算机存储介质及电子设备
基本信息
| 申请号 | CN202111257801.2 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113990394A | 公开（公告）日 | 2022-01-28 |
| 申请公布号 | CN113990394A | 申请公布日 | 2022-01-28 |
| 分类号 | G16B30/10（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 胡杨俊;韩永红;许晓静 | 申请（专利权）人 | 云舟生物科技（广州）股份有限公司 |
| 代理机构 | 广州国鹏知识产权代理事务所（普通合伙） | 代理人 | 葛红 |
| 地址 | 510663 广东省广州市科学城掬泉路3号广州国际企业孵化器D区D301-D309号房 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供了一种向导RNA作用靶点的筛选方法、计算机存储介质及电子设备，方法包括以下步骤：S1、从基因序列库中获取PAM序列；S2、将PAM序列的NGG以及PAM序列的前n个碱基取出，生成向导RNA；S3、将向导RNA与基因序列库比对，判断向导RNA的基因在基因序列库中的位置；S4、获取向导RNA中每个基因上游的m个碱基，以及对应基因的碱基区域的向导RNA，在含有基因的向导RNA进行打靶，剔除没有基因的向导RNA；S5、剔除含有连续a个T的向导RNA；S6、剔除没有在转录本外显子上的向导RNA；S7、获取未被剔除的向导RNA，筛选含有设定前缀的转录本的向导RNA；S8、获取步骤S7得到的向导RNA的基因，形成具有设定前缀的转录本序列；S9、截取转录本序列中预定长度的序列。 |
