Sanger法测序中确定单核苷酸多态性的方法

基本信息

申请号 CN201910332899.X 申请日 -
公开(公告)号 CN110016498A 公开(公告)日 2019-07-16
申请公布号 CN110016498A 申请公布日 2019-07-16
分类号 C12Q1/6869;G16B40/10 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 杨志凯;张延明;杜楠;王柏婧;张萱;朱政英;王忠杰;许志华;万丽君;周鑫峰 申请(专利权)人 北京诺赛基因组研究中心有限公司
代理机构 北京汉鼎理利专利代理事务所(特殊普通合伙) 代理人 潘满根
地址 100176 北京市大兴区北京经济技术开发区永昌北路3号1号楼1层01
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种Sanger法测序中确定单核苷酸多态性的方法,所述方法包括将来源于同一个待测序列的所述高质量的碱基序列文件通过构建kmer哈希表,以kmer序列为哈希表的键,以kmer序列在整条序列中出现的次数为该键所对应的值,使用kmer值进行所述高质量碱基序列拼接组装。本发明的Sanger法测序中确定单核苷酸多态性的方法可以实现全分析流程自动化,只需设置好相关参数,中间无需人工参与,直接输出结果文件。