双层互强化的蛋白质三维结构预测方法及系统
基本信息
| 申请号 | CN202110626528.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113223608A | 公开（公告）日 | 2021-08-06 |
| 申请公布号 | CN113223608A | 申请公布日 | 2021-08-06 |
| 分类号 | G16B15/20;G16B40/00;G16B50/30;G06F16/2455;G06N3/04;G06N3/08 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 苗洪江;汤一珂;沈邱难;薛贵荣 | 申请（专利权）人 | 上海天壤智能科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海段和段律师事务所 | 代理人 | 黄磊;郭国中 |
| 地址 | 201100 上海市闵行区剑川路951号5幢1层（集中登记地） | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供了一种双层互强化的蛋白质三维结构预测方法及系统，包括：获取蕴含蛋白质共进化信息的多序列排列矩阵以及蛋白质模版，并分别转化成嵌入向量，输入到基于注意力机制的多头神经网络；通过在序列边和残基边分别进行并互相更新的方式提取蛋白质中每对氨基酸序列的相互作用关系；多头神经网络的一个头输出每对儿氨基酸残基间距离的概率分布，另一个头输出每个氨基酸残基扭转角的角度概率分布；根据输出的每对儿氨基酸残基间距离的概率分布和每个氨基酸残基扭转角的角度概率分布，通过梯度下降法得到最符合的预测距离/角度的三维结构作为预测结果。本发明能够让网络能够更加均衡地提取全局化信息，从而更准确地预测蛋白质整体三维结构。 |
