一种PCR引物设计模板筛选的方法及应用

基本信息

申请号 CN202011517283.9 申请日 -
公开(公告)号 CN112634990A 公开(公告)日 2021-04-09
申请公布号 CN112634990A 申请公布日 2021-04-09
分类号 G16B25/20;G16B30/10;G16B20/20;C12Q1/70;C12Q1/686;C12Q1/6811 分类 物理
发明人 黄晓强;蒙裕欢;欧小华;缪夏萍;李桂彬;范喜杰;严慧;于世辉 申请(专利权)人 广州市金域转化医学研究院有限公司
代理机构 广州新诺专利商标事务所有限公司 代理人 李海恬;沈芳
地址 510000 广东省广州市国际生物岛螺旋三路10号南楼319房
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种PCR引物设计模板筛选的方法及应用,涉及分子生物学检测技术领域。本发明的方法包括:从数据库获取目标种属的基因组,所述基因组中包括已知的变异株的基因组序列,进行多序列全局对比并分析基因组变异;根据目标种属基因组比对文件,确定基因组中的高度保守序列;计算高度保守序列的GC%与碱基随机性;以高度保守序列的GC%与碱基随机性作为筛选参数,对高度保守序列的引物设计模板进行筛选。该方法可系统高效地筛选PCR引物设计模板,采用该模板设计得到的PCR引物具有高特异性和高效率的特点。