针对16SrDNA鉴定的一代测序数据拼接方法
基本信息
| 申请号 | CN202210020674.2 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN114512190A | 公开（公告）日 | 2022-05-17 |
| 申请公布号 | CN114512190A | 申请公布日 | 2022-05-17 |
| 分类号 | G16B30/10（2019.01）I;G16B50/30（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 王美霞;李宏;车阳;孙晓飞;陶津;洪文杰;王焕英;王庭璋 | 申请（专利权）人 | 浙江天科高新技术发展有限公司 |
| 代理机构 | 杭州求是专利事务所有限公司 | 代理人 | - |
| 地址 | 310012浙江省杭州市黄姑山路9号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种针对16S rDNA鉴定的一代测序数据拼接方法。包括：建立基于比对模块和拼接模块的序列拼接程序，实现对一代测序下机待分析序列数据的拼接，输出可用于后续鉴定分析的完整序列；比对模块包括比对模型，打分标准和优选标准；比对模型使用一个方向进行打分计算和回溯；打分标准引入了简并碱基的概念，将4个碱基扩展到15个碱基，包括A、T、C、G、R、Y、M、K、S、W、H、B、V、D、N；其中，完全相同的碱基、简并碱基包含正常碱基时打分为10分，任意碱基比对N为1分，任意碱基比对“‑”为2分，相同位点两个碱基不同为2分。本发明建立了全新的序列拼接的核心思想，具有速度快、运算量小、准确率高等优点。 |
