一种细菌DNA序列快速注释方法及装置

基本信息

申请号 CN202010795329.7 申请日 -
公开(公告)号 CN112017729A 公开(公告)日 2020-12-01
申请公布号 CN112017729A 申请公布日 2020-12-01
分类号 G16B20/30(2019.01)I;G16B30/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 华孝挺;俞云松;陈欢;梁倩;洪文杰;何锦涛;张玲虹 申请(专利权)人 浙江天科高新技术发展有限公司
代理机构 杭州求是专利事务所有限公司 代理人 应孔月
地址 310058浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种细菌DNA序列快速注释方法及装置,该方法分别构建ResDB、ISDB、IntegronDB和TransposonDB数据库;获取待分析的细菌DNA序列;利用BLASTN程序将待分析的细菌DNA序列与ResDB、ISDB、IntegronDB和TransposonDB数据库中的一个或多个进行比对;根据比对的覆盖率和一致性,获得最佳匹配基因和最佳匹配基因对应的查询基因的比对片段序列信息,并输出注释结果。该方法将有助于简化和优化目前的基因组分析流程,加快后续的基因组分析。