筛选甲基化PCR检测的目标区域的方法、试剂盒及应用
基本信息
| 申请号 | CN201810059375.3 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN108410980B | 公开（公告）日 | 2022-02-01 |
| 申请公布号 | CN108410980B | 申请公布日 | 2022-02-01 |
| 分类号 | C12Q1/6886（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 叶明芝;郑春婷;曾柳红;李志隆;宋炎;茅矛 | 申请（专利权）人 | 深圳华大医学检验实验室 |
| 代理机构 | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 | 代理人 | 李小焦;彭家恩 |
| 地址 | 518083 广东省深圳市盐田区盐田街道东海社区洪安三街21号南方明珠公寓7号楼1203 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本申请公开了一种筛选甲基化PCR检测的目标区域的方法、试剂盒及应用。本申请的方法包括（1）从数据库中获取待分析肿瘤甲基化芯片及对应转录组测序数据；（2）统计正常组与癌症组的甲基化程度值，筛选不同组别中具有显著差异的甲基化位点；（3）联合转录组测序表达谱的分析，统计相关系数，筛选负相关位点；（4）将步骤（3）获取的甲基化候选位点，与披露的相关文献关联，筛选获得文献支持报道多且组间甲基化差异程度大、表达量负相关位点；使用回归算法，获取最佳敏感性、特异性的位点集合，即目标区域。本申请的方法，综合分析数据库、转录组测序和文献，并结合多重数据过滤和回归算法，能灵敏、特异的获得甲基化PCR检测目标区域。 |
