FFPE样本建库的方法及其应用

基本信息

申请号 CN202110506226.9 申请日 -
公开(公告)号 CN113005525A 公开(公告)日 2021-06-22
申请公布号 CN113005525A 申请公布日 2021-06-22
分类号 C40B50/06;C40B40/06;C12Q1/6869 分类 组合技术〔8〕;
发明人 胡玉刚;汪彪;郑文莉;吴强 申请(专利权)人 纳昂达(南京)生物科技有限公司
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 代理人 路秀丽
地址 210000 江苏省南京市江北新区华康路142号南京生物医药谷加速器三期A01栋南侧3-4层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种FFPE建库的方法及其应用。该方法包括:通过利用内切酶进行酶切片段化,对片段化DNA依次进行末端修复加A及接头连接,对连上接头的DNA片段进行PCR扩增,得到测序文库,其中内切酶具有如下功能:a)在DNA缺口处切割;b)保留双链末端突出碱基部分。由于FFPE在固定的过程中和固定之前都有带来降级和部分碱基的脱落,该方法充分利用FFPE的本身的缺口问题,能够在缺口处断裂DNA片段的酶打断DNA后结合正常的补平加A、连接接头和PCR扩增的方式进行建库,解决了由于FFPE本身的损伤和打断损伤不兼容导致的建库效率低的问题,从而解决了降解比较严重的样本难以建库的问题。