在RNA建库过程中封闭核糖体RNA或球蛋白RNA的探针及其应用

基本信息

申请号 CN202111216082.X 申请日 -
公开(公告)号 CN113862334A 公开(公告)日 2021-12-31
申请公布号 CN113862334A 申请公布日 2021-12-31
分类号 C12Q1/6806(2018.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C40B50/06(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 宋东亮;江翱;曹振;陈晶晶;侯策;王嫚;刘倩 申请(专利权)人 翌圣生物科技(上海)股份有限公司
代理机构 苏州根号专利代理事务所(普通合伙) 代理人 朱华庆
地址 200120上海市浦东新区天雄路166弄1号楼402室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种在RNA建库过程中封闭核糖体RNA或球蛋白RNA的探针,探针长度为35‑60 nt,探针与核糖体RNA或球蛋白RNA通过互补配对形成三元封闭复合物。探针的后半区域与靶RNA严格互补配对,探针配对区域的5’端5‑9个碱基被修饰碱基代替;探针的前半区域是嘧啶碱基,用于嵌合到DNA/RNA双链的大沟中形成三元复合物。探针的3’‑OH利用MGB进行封闭,用于防止探针作为引物进行延伸;同时MGB可嵌合到DNA/RNA双链的小沟,提高三元复合物的稳定性。并公开了其在RNA建库中快速去除核糖体RNA或球蛋白RNA的应用。本发明具有操作简单、耗时极短、特异性强、适用性广、去除效率高和基因检出数高等优点,适合用于工业自动化建库和疾病快速诊断领域。