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肿瘤相关基因甲基化检测建库方法及应用

基本信息

申请号	CN201810176374.7	申请日	-
公开（公告）号	CN108410969A	公开（公告）日	2018-08-17
申请公布号	CN108410969A	申请公布日	2018-08-17
分类号	C12Q1/6869;C40B50/06	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	方圆	申请（专利权）人	上海渥恩生物科技有限公司
代理机构	北京维正专利代理有限公司	代理人	上海渥恩生物科技有限公司
地址	201700 上海市青浦区城中西路111号4幢三层C区344室
法律状态	-

摘要

本发明公开了肿瘤相关基因甲基化检测建库方法及应用，该方法使用内侧引物对，采用多重PCR法进行第一轮扩增，扩增产物序列分别为DNA转化的正链和负链，内侧引物5’端使用与外侧引物3’端互补的20~25个碱基，3’端使用根据目标靶点外侧的序列所设计的特异性引物序列，然后使用illumina Multiplexing PCR Primer 1.0为外侧引物F和使用3’端截断后的illumina RNA PCR Primer为外侧引物R进行第二轮扩增，从而构建文库。采用本方法可同时富集多个肿瘤相关基因，所需样本起始量超低，测序成本较低，通过双链扩增和二代测序分析，可剔除转化效率问题导致的假阳性，提高ctDNA检出率。