单菌DNA文库测序数据的注释方法及相关设备
基本信息
申请号 | CN202111388983.7 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN114360647A | 公开(公告)日 | 2022-04-15 |
申请公布号 | CN114360647A | 申请公布日 | 2022-04-15 |
分类号 | G16B30/10(2019.01)I;G16B30/20(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 葛琳娜;杨海生;李明壮 | 申请(专利权)人 | 荣联科技集团股份有限公司 |
代理机构 | 北京风雅颂专利代理有限公司 | 代理人 | 郑颖颖 |
地址 | 100080北京市海淀区北四环西路56号10层1002-1 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本申请提供一种单菌DNA文库测序数据的注释方法、装置、电子设备及存储介质。注释方法包括:对原始测序数据进行碱基质量评估、接头序列过滤、低质量序列过滤和低质量碱基过滤,得到高质量的序列数据;同时基于多种组装方法分别拼接高质量的序列数据,评估得到最优拼接序列数据;进行基因组结构预测、重复序列分析和CRISPR结构分析,得到最优拼接序列的预测结果信息;分别将最优拼接序列与多种功能数据库进行比对,得到最优拼接序列的功能注释信息。能够充分考虑各个分析环节的资源需求和分析时间等因素,具有良好的分析效率、任务调度、内存和线程分配等性能,能够高效的得到全面且可靠的单菌DNA文库测序数据的注释信息。 |
