基因测序数据读取方法及系统

基本信息

申请号 CN201210592061.2 申请日 -
公开(公告)号 CN103049680A 公开(公告)日 2016-09-07
申请公布号 CN103049680A 申请公布日 2016-09-07
分类号 G06F19/20;G06F17/21 分类 计算;推算;计数;
发明人 孟金涛;魏延杰;成杰峰;冯圣中 申请(专利权)人 深圳市弘志拓新创业投资企业(有限合伙)
代理机构 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 宋鹰武
地址 518055广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及生物信息学技术领域,提出了一种基因测序数据读取方法,包括如下步骤:对用户参数进行解析,确定任务个数;根据任务个数将测序数据分割成相同大小的文件块;对每个文件块的起始地址和终止地址进行调整;各任务对调整后的文件块结果进行读取。本发明还提供了基因测序数据读取系统及设有所述系统的基因测序数据分析装置。本发明实现了基因测序数据的并行读取,且各个文件块大小均匀,还避免了将一个序列分割到两个不同的文件块中。