预测肿瘤新生抗原的方法、装置及存储介质
基本信息
| 申请号 | CN201811531729.6 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109584960A | 公开（公告）日 | 2019-04-05 |
| 申请公布号 | CN109584960A | 申请公布日 | 2019-04-05 |
| 分类号 | G16B20/50（2019.01）I; G16B50/00（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 叶浩; 李祥永; 戴珩 | 申请（专利权）人 | 上海鲸舟基因科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海智信专利代理有限公司 | 代理人 | 上海鲸舟基因科技有限公司;序康医疗科技（苏州）有限公司 |
| 地址 | 201318 上海市浦东新区康新公路3399弄19号楼A区4-5层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及一种预测肿瘤新生抗原的方法，包括步骤：(1)根据肿瘤‑胚系对照样本进行体细胞突变以及基因融合检测；(2)针对每一对融合基因生成融合突变肽及相应野生肽；(3)基于每个体细胞突变生成突变肽及相应野生肽；(4)构建肿瘤样本特异的个人基因组并生成含有多个突变的突变肽；(5)判断单突变以及多突变的突变肽真伪；(6)去除与野生型蛋白其它位置序列完全一致的突变肽；(7)进行HLA分子分型检测，预测新生多肽与HLA分子的亲和力，将亲和力高的新生多肽作为候选肿瘤新生抗原。本发明还提供了相应的装置和计算机存储介质。采用了本发明的方法、装置及存储介质，能有效肿瘤治疗响应生物标志物评估，为肿瘤疫苗设计提供精准的候选肽段。 |
