检测低频变异用的接头、接头混合物及相应方法

基本信息

申请号 CN201811608440.X 申请日 -
公开(公告)号 CN109439729A 公开(公告)日 2019-03-08
申请公布号 CN109439729A 申请公布日 2019-03-08
分类号 C12Q1/6827(2018.01)I; C12N15/11(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 黄炳顶; 章扬; 任勇哲; 王丹丹; 戴珩; 史耀舟 申请(专利权)人 上海鲸舟基因科技有限公司
代理机构 上海智信专利代理有限公司 代理人 上海鲸舟基因科技有限公司;序康医疗科技(苏州)有限公司
地址 201318 上海市浦东新区康新公路3399弄19号楼A区4-5层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种检测低频变异用的接头,所述的接头包括两条互补DNA单链,其中一条链P5链从5’端到3’端依次包括:与上游扩增引物部分重合的序列;与上游测序引物结合的序列;特定核苷酸序列组合的分子标签;1个突出碱基T;另一条链P7链从5’端到3’端依次包括三部分:与P5链中分子标签反向互补的分子标签;与下游测序引物结合的序列;与下游扩增引物结合的序列。本发明还涉及一种检测低频变异用的接头混合物及相应方法。使用本发明的接头混合物对含有低频变异和单链损伤的样本进行文库制备和高通量测序,再结合本发明公开的生物信息分析流程和算法,有效提高变异检测的准确性。