获取基于内含子体细胞变异的免疫治疗新抗原方法和装置

基本信息

申请号 CN202110251696.5 申请日 -
公开(公告)号 CN113035272A 公开(公告)日 2021-06-25
申请公布号 CN113035272A 申请公布日 2021-06-25
分类号 G16B20/20;G16B20/30;G16B20/50;G16B30/10 分类 物理
发明人 万季;汪健;沈一鸣;夏迪;潘有东;王弈;宋麒 申请(专利权)人 深圳市新合生物医疗科技有限公司
代理机构 北京冠和权律师事务所 代理人 吴金水
地址 518055 广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种获取基于内含子体细胞变异的免疫治疗新抗原方法和装置,涉及肿瘤免疫治疗领域,方法包括以下步骤:基于全基因组测序数据或全外显子组测序数据检测获取肿瘤组织遗传物质中,发生在内含子区域的体细胞变异,并得到相关数据;基于肿瘤组织的转录组测序数据和S1最终所得数据,确定由S1检测获取的内含子体细胞变异所导致的异常剪接事件,并重建所得异常剪接事件的转录本序列;根据所得转录本序列,获取肿瘤特异候选新抗原肽段,并从中筛选出作为肿瘤特异新抗原肽的肿瘤特异新抗原;本发明通过鉴定内含子体细胞变异导致的异常剪接事件所产生的新抗原,扩展了新抗原的选择范围。