一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法
基本信息
| 申请号 | CN202110696080.9 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113362896A | 公开（公告）日 | 2021-09-07 |
| 申请公布号 | CN113362896A | 申请公布日 | 2021-09-07 |
| 分类号 | G16B25/10;G16B30/00;C12Q1/6869 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 万季;刘鹏;沈一鸣;潘有东;王弈 | 申请（专利权）人 | 深圳市新合生物医疗科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京冠和权律师事务所 | 代理人 | 赵银萍 |
| 地址 | 518055 广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法，属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤：S01，组装肿瘤样品转录本；S02，筛选样本HPV整合转录本；S03，翻译HPV整合转录本为多肽；S04，获取多肽短序列片段，并过滤人类正常蛋白质组中多肽；S05，样品人类白细胞抗原基因分型；S06，肽段亲和力预测、新抗原筛选。本发明得到的新抗原是HPV整合的结果，与疾病进展过程密切相关。本发明得到的新抗原来自于RNA测序数据，是细胞转录的结果，有更高的概率翻译产生蛋白质。 |
