一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统

基本信息

申请号 CN202011098269.X 申请日 -
公开(公告)号 CN112309502A 公开(公告)日 2021-02-02
申请公布号 CN112309502A 申请公布日 2021-02-02
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 万季;沈一鸣;汪健;潘有东;王弈;宋麒 申请(专利权)人 深圳市新合生物医疗科技有限公司
代理机构 北京冠和权律师事务所 代理人 田鸿儒
地址 518055广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统,其中方法包括:步骤S1:整合样本正常及肿瘤数据,对特定区间进行测序并检测样本的体细胞突变;步骤S2:对体细胞突变进行注释过滤,并进行翻译得到患者的突变多肽序列;步骤S3:根据样本正常蛋白质组,过滤突变多肽序列,得到新多肽序列;步骤S4:根据样本正常比对数据进行人类白细胞抗原分型分析,得到样本的HLA基因型;本发明的计算肿瘤新抗原负荷的方法,对每一个预测的新抗原进行权重打分,考虑到突变质量、突变频率以及亲和力高低等不同维度信息,能够区别高质量和低质量的新抗原,从而得到一个更能反应样本真实肿瘤新抗原负荷的数值。