一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统
基本信息
申请号 | CN202011098269.X | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112309502A | 公开(公告)日 | 2021-02-02 |
申请公布号 | CN112309502A | 申请公布日 | 2021-02-02 |
分类号 | G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 万季;沈一鸣;汪健;潘有东;王弈;宋麒 | 申请(专利权)人 | 深圳市新合生物医疗科技有限公司 |
代理机构 | 北京冠和权律师事务所 | 代理人 | 田鸿儒 |
地址 | 518055广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统,其中方法包括:步骤S1:整合样本正常及肿瘤数据,对特定区间进行测序并检测样本的体细胞突变;步骤S2:对体细胞突变进行注释过滤,并进行翻译得到患者的突变多肽序列;步骤S3:根据样本正常蛋白质组,过滤突变多肽序列,得到新多肽序列;步骤S4:根据样本正常比对数据进行人类白细胞抗原分型分析,得到样本的HLA基因型;本发明的计算肿瘤新抗原负荷的方法,对每一个预测的新抗原进行权重打分,考虑到突变质量、突变频率以及亲和力高低等不同维度信息,能够区别高质量和低质量的新抗原,从而得到一个更能反应样本真实肿瘤新抗原负荷的数值。 |
