一种基于网格搜索的规则权重分配siRNA设计方法

基本信息

申请号 CN202110251670.0 申请日 -
公开(公告)号 CN112951322A 公开(公告)日 2021-06-11
申请公布号 CN112951322A 申请公布日 2021-06-11
分类号 G16B20/00;G06K9/62 分类 物理
发明人 万季;刘鹏;沈一鸣;徐韵婉;潘有东;王弈;宋麒 申请(专利权)人 深圳市新合生物医疗科技有限公司
代理机构 北京冠和权律师事务所 代理人 吴金水
地址 518055 广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于网格搜索的规则权重分配siRNA设计方法,涉及生物信息学技术领域,包括以下步骤:S1、从siRNA数据中训练得到siRNA设计规则权重;S2、基于得到的siRNA设计规则权重从候选siRNA集合中筛选出高沉默效率siRNA。本发明按照不同权重来区别对待每条规则,基于不同权重的多规则设计,可以避免将所有规则按同等重要程度对待,突出其中的重要规则,可以区分出有效的siRNA和无效的siRNA,并且能定量预测候选siRNA序列的效率。