一种利用宏基因组或宏转录组检测微生物的分析方法
基本信息
| 申请号 | CN201910537997.7 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN110349629B | 公开（公告）日 | 2021-08-06 |
| 申请公布号 | CN110349629B | 申请公布日 | 2021-08-06 |
| 分类号 | G16B30/10;G16B40/00 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 龚浩;何雪莹;余旻斐;陈杰 | 申请（专利权）人 | 广州赛哲生物科技股份有限公司 |
| 代理机构 | 广州粤高专利商标代理有限公司 | 代理人 | 段卉 |
| 地址 | 410006 湖南省长沙市岳麓区学士街道学士路336号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种利用宏基因组或宏转录组检测微生物的分析方法。所述分析方法对测序下机数据进行数据质控，过滤后得到高质量数据，然后并行进行组装和双端拼接(单端则不拼接)，组装和拼接所得数据基于bwa算法比对到微生物参考数据库，鉴定样本内微生物物种及其丰度信息。过滤低质量结果后整合分析结果。本发明方法适用范围广，能检测多种类型微生物，兼容多种主流测序平台，兼顾单端、双端测序数据及长读长、短读长序列数据特点，可从各类型测序数据准确地分析样本内微生物物种及其丰度。本发明方法能够有效降低假阳性，克服大部分微生物无法培养的难点，准确、快速、全面检测各类型样本内微生物。 |
