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无参考基因组序列的转录组分析方法及系统

基本信息

申请号 CN202011255655.5 申请日 -
公开（公告）号 CN112397149A 公开（公告）日 2021-02-23
申请公布号 CN112397149A 申请公布日 2021-02-23
分类号 G16B30/10(2019.01)I; 分类 物理
发明人 田振阳;王苹 申请（专利权）人 天津现代创新中药科技有限公司
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 代理人 路秀丽
地址 300142天津市西青区海泰发展六道绿色产业基地2期M1座
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种无参考基因组序列的转录组分析方法及系统。该分析方法包括：获取待测样本的二代RNA有效测序数据和三代RNA有效测序数据；利用二代RNA有效测序数据对三代RNA有效测序数据进行校正；对三代校正后的有效数据进行去冗余获得unigene序列；将二代RNA有效测序数据与unigene序列进行序列比对，利用比对文件，对每个unigene序列上的reads数进行统计，获得每个基因的表达水平FPKM值。该分析方法整合了二代和三代测序技术的优势，解决了目前尚无利用三代测序数据进行对无参考基因组序列的转录组进行分析的问题。