病原微生物分析鉴定系统及应用

基本信息

申请号 CN202010281509.3 申请日 -
公开(公告)号 CN111462821B 公开(公告)日 2022-02-22
申请公布号 CN111462821B 申请公布日 2022-02-22
分类号 G16B30/00 分类 物理
发明人 许腾;陈文景;张丽珍;刘足;潘秀莹;曾伟奇;秦璐;李永军;王小锐;苏杭 申请(专利权)人 微远(深圳)医学研究中心有限公司
代理机构 广州新诺专利商标事务所有限公司 代理人 李海恬
地址 510130 广东省广州市高新技术产业开发区科丰路31号自编三栋华南新材料创新园G10栋301号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种病原微生物分析鉴定系统及应用,属于基因检测分析技术领域。该病原微生物分析鉴定系统包括:数据获取模块:用于获取高通量测序得到的基因测序数据;数据过滤模块:用于将依次进行低质量序列过滤、宿主序列过滤;数据比对模块:用于将序列比对至病原微生物基因组数据库中;物种比对模块:用于统计待分析序列;数据分析模块:用于计算共有比对序列集中各序列对比上每一个物种的相似度S和平均相似度值SMSi;物种序列模块:用于计算物种的总比对序列数SNTi;结果输出模块:用于进行生物信息学分析,得到病原微生物分析鉴定结果。该病原微生物分析鉴定系统不仅具有分析时间短、准确性高的优点;还可准确得检测混合感染,获得具体病原体信息。