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细胞Hi-C测序文库的构建方法

基本信息

申请号 CN202010725027.2 申请日 -
公开（公告）号 CN111778563A 公开（公告）日 2020-10-16
申请公布号 CN111778563A 申请公布日 2020-10-16
分类号 C40B50/06(2006.01)I 分类 组合技术〔8〕;
发明人 李新;刘贝贝;李瑞强;赵桂仿 申请（专利权）人 天津诺禾致源生物信息科技有限公司
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 代理人 天津诺禾致源生物信息科技有限公司
地址 301700天津市武清区开发区创业总部基地B07
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种细胞Hi‑C测序文库的构建方法。该构建方法包括采用体积≤800μL且甲醛终浓度为1.5～2.2％的交联体系对105数量级细胞进行甲醛交联固定，然后采用优化的裂解体系及温度对交联细胞进行处理，得到细胞核悬液；对细胞核进行Hi‑C文库构建得到Hi‑C测序文库；细胞膜裂解液包括终浓度分别如下的成分：pH 7.8～8.2，9～11mM的Tris‑HCl、9～11mM NaCl、0.1～0.3％的CA‑630、1×的蛋白酶抑制剂。小体积体系对低细胞起始量固定，并优化细胞膜裂解体系及反应条件，确保细胞核的完整性，提高了细胞核DNA的量及纯度，进而提高建库效率(提高有效数据的占比)。