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冰冻植物组织Hi-C建库的方法

基本信息

申请号	CN202010821338.9	申请日	-
公开（公告）号	CN111808927A	公开（公告）日	2020-10-23
申请公布号	CN111808927A	申请公布日	2020-10-23
分类号	C12Q1/6806(2018.01)I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	李彪;郭松;仉旭;沈世超	申请（专利权）人	天津诺禾致源生物信息科技有限公司
代理机构	北京康信知识产权代理有限责任公司	代理人	天津诺禾致源生物信息科技有限公司
地址	301700天津市武清区武清开发区创业总部基地B07
法律状态	-

摘要

本发明公开了一种冰冻植物组织Hi‑C建库的方法。该方法包括以下步骤：S1，冰冻植物组织液氮研磨；S2，加入甲醛进行固定，加入甘氨酸进行终止固定；S3，过细胞筛网；S4，将固定化的细胞进行细胞裂解，然后进行限制性内切酶消化；S5，进行标记物标记，并平末端化；S6，重新连接；S7，解除固定化，进行DNA片段的提取，回收DNA片段；S8，去除带有标记物标记但未连接的DNA片段；S9，DNA打断；S10，钓取含有标记物标记的DNA片段；S11，末端修复加接头；S12，PCR扩增，获得Hi‑C文库。应用本发明的建库的方法，利用冰冻植物组织进行Hi‑C建库，可以达到与新鲜叶片Hi‑C建库同等的有效数据率。