一种区分DNA中5-甲基化胞嘧啶和5-羟甲基化胞嘧啶的方法

基本信息

申请号 CN201910624669.0 申请日 -
公开(公告)号 CN110527708A 公开(公告)日 2019-12-03
申请公布号 CN110527708A 申请公布日 2019-12-03
分类号 C12Q1/6806;C12Q1/6858 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 刘震;李阳 申请(专利权)人 武汉伯远生物科技有限公司
代理机构 上海精晟知识产权代理有限公司 代理人 穆旭
地址 430000 湖北省武汉市东湖开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B1栋(B8-5)
法律状态 -

摘要

摘要 本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5‑甲基化胞嘧啶和5‑羟甲基化胞嘧啶的方法。该方法基于APOBEC3A对5‑mC和5‑hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3’末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被检测位点的修饰是甲基化修饰还是羟甲基化修饰,提高了分析时效性,节约了二次测序成本。该方法转化过程对DNA几乎无损伤作用,可利用低至1ng的样本DNA完成分析,能够广泛应用于DNA表观遗传分析领域。