一种高效低成本鉴定转基因元件插入位点的方法及其应用

基本信息

申请号 CN202111517433.0 申请日 -
公开(公告)号 CN114108104A 公开(公告)日 2022-03-01
申请公布号 CN114108104A 申请公布日 2022-03-01
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C40B40/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12N15/11(2006.01)I;G16B30/00(2019.01)I 分类 组合技术〔8〕;
发明人 李阳;吴磊 申请(专利权)人 武汉伯远生物科技有限公司
代理机构 武汉天领众智专利代理事务所(普通合伙) 代理人 王能德
地址 430000湖北省武汉市东湖开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B1栋(B8-5)
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种高效低成本鉴定转基因元件插入位点的方法及其应用,方法包括如下步骤:S1、提取转基因阳性样本全基因组,然后加入Tn5转座酶进行打断建库,得到第一混合物;S2、采用带有barcode序列的引物,经PCR扩增所述第一混合物,得到带有不同barcode序列的第二混合物;S3、纯化所述带有不同barcode序列的第二混合物,然后将纯化后的第二混合物均一混合后,进行高通量测序;S4、对高通量测序数据进行数据分析,鉴定获得转基因元件的插入位点信息;本方法建库流程简单:采用Tn5转座酶建库,流程简单快速;成本低廉:可以进行多样品混测,并且是利用PCR扩增反应靶向富集目标序列侧翼序列,对于测序量要求不高,1G测序量的成本能满足分析几十个样品的分析需求。