用于预测体细胞变异真假的方法、电子设备和存储介质

基本信息

申请号 CN202210243842.4 申请日 -
公开(公告)号 CN114708906A 公开(公告)日 2022-07-05
申请公布号 CN114708906A 申请公布日 2022-07-05
分类号 G16B20/20(2019.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 董筱微;柳文进;车月 申请(专利权)人 上海至本医学检验所有限公司
代理机构 北京市金杜律师事务所 代理人 -
地址 201203上海市浦东新区自由贸易试验区芳春路400号1幢3层
法律状态 -

摘要

摘要 本公开涉及一种用于预测体细胞变异真假的方法、计算设备和存储介质。该方法包括:获取关于待测对象的肿瘤样本的比对结果数据、对照样本的比对结果数据、以及关于肿瘤样本的体细胞变异位点的数据;获取经过体细胞变异位点所在基因组位置的、关于肿瘤样本的肿瘤样本读长以及关于对照样本的对照样本读长;针对肿瘤样本读长和对照样本读长中的每个基因组位置,提取关于A、C、G、T四种碱基和插入缺失变异的特征信息;基于所提取的特征信息,生成预测模型的输入数据;以及基于经由多样本训练的预测模型,提取所述输入数据的特征,以便基于所提取的特征预测体细胞变异的真假。本公开能够自动、快速并准确地判断体细胞变异真假。