多重PCR引物设计方法和装置

基本信息

申请号 CN202210500808.0 申请日 -
公开(公告)号 CN114596968A 公开(公告)日 2022-06-07
申请公布号 CN114596968A 申请公布日 2022-06-07
分类号 G16H70/40;G16B20/30;G16B20/50 分类 物理
发明人 王维锋;郑新;姚继成 申请(专利权)人 上海至本医学检验所有限公司
代理机构 华进联合专利商标代理有限公司 代理人 张灵莉
地址 200000 上海市中国(上海)自由贸易试验区芳春路400号1幢3层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种多重PCR引物设计方法和装置,方法包括:获取肿瘤样本的变异信息,根据所述变异信息选取预设数量的监测位点以构成监测位点集合;根据每个监测位点在参考基因组上对应的目标序列设计至少一个候选引物对,对于每个监测位点选取一个候选引物对以生成监测位点集合对应的评估引物对集合;对评估引物对集合来自于不同候选引物对的两两引物进行引物二聚体评估,根据评估引物对集合中所有引物的引物二聚体评估结果筛选合格的候选引物对作为目标多重PCR引物。本发明的多重PCR引物设计方法,能够针对性地对肿瘤患者的突变位点设计多重PCR引物,实现稳定检出丰度≥0.02%的ctDNA突变信息的目的。