HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法
基本信息
| 申请号 | CN201080070269.7 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN103221551B | 公开（公告）日 | 2015-10-07 |
| 申请公布号 | CN103221551B | 申请公布日 | 2015-10-07 |
| 分类号 | C12Q1/68(2006.01)I | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 曹红志;张伟;王煜 | 申请（专利权）人 | 北京六合华大基因科技有限公司 |
| 代理机构 | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人 | 深圳华大基因股份有限公司;北京六合华大基因科技有限公司 |
| 地址 | 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明属于基因组学和生物信息领域，涉及HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法。具体地，所述构建HLA基因型别-SNP连锁数据库的方法，包括如下步骤：a）选择一个或多个HLA基因座的序列作为参考序列；b）将现有HLA数据库中已知型别的HLA基因与参考序列比对，找出与参考序列的差异位点即SNP位点，得到每个型别相对于参考序列的SNP连锁关系，构建HLA基因型别-SNP连锁数据库。本发明还涉及确定HLA基因的SNP连锁关系的方法，以及HLA分型装置。本发明的分型方法实现了HLA的低成本，高通量、高准确率、高分辨率的分型。 |
