用于加速变异位点的识别的方法及系统

基本信息

申请号 CN201710717876.1 申请日 -
公开(公告)号 CN110021342B 公开(公告)日 2020-12-15
申请公布号 CN110021342B 申请公布日 2020-12-15
分类号 G16B20/00 分类 物理
发明人 张中海;李旭;徐俊韬;曾平;张春明 申请(专利权)人 北京哲源科技有限责任公司
代理机构 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 代理人 北京哲源科技有限责任公司
地址 100095 北京市海淀区中关村环保科技示范园龙芯产业园1号楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种用于加速变异位点的识别的方法,其将参考基因组的各染色体划分为一个或多个区间,基于各区间的测序片段密度来设置各区间的处理优先级,并根据各区间的处理优先级来处理各区间中的测序片段,获取各区间中与每个位点的堆叠相关的统计数据,从而判断各位点是否发生变异。该方法将参考基因组划分成多个区间,可以在多个核上同时并行处理各区间的相关数据,能有效利用现有的多核计算资源并缩短计算时间。