用于加速变异位点的识别的方法及系统
基本信息
申请号 | CN201710717876.1 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN110021342B | 公开(公告)日 | 2020-12-15 |
申请公布号 | CN110021342B | 申请公布日 | 2020-12-15 |
分类号 | G16B20/00 | 分类 | 物理 |
发明人 | 张中海;李旭;徐俊韬;曾平;张春明 | 申请(专利权)人 | 北京哲源科技有限责任公司 |
代理机构 | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 | 代理人 | 北京哲源科技有限责任公司 |
地址 | 100095 北京市海淀区中关村环保科技示范园龙芯产业园1号楼 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供一种用于加速变异位点的识别的方法,其将参考基因组的各染色体划分为一个或多个区间,基于各区间的测序片段密度来设置各区间的处理优先级,并根据各区间的处理优先级来处理各区间中的测序片段,获取各区间中与每个位点的堆叠相关的统计数据,从而判断各位点是否发生变异。该方法将参考基因组划分成多个区间,可以在多个核上同时并行处理各区间的相关数据,能有效利用现有的多核计算资源并缩短计算时间。 |
