一种基因测序数据重组封装的方法和装置
基本信息
| 申请号 | CN202110810347.2 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113268461B | 公开（公告）日 | 2021-09-17 |
| 申请公布号 | CN113268461B | 申请公布日 | 2021-09-17 |
| 分类号 | G06F16/174（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I;G16B50/50（2019.01）I | 分类 | 计算；推算；计数; |
| 发明人 | 郭祥学;张巍 | 申请（专利权）人 | 广州嘉检医学检测有限公司 |
| 代理机构 | 广州君策达知识产权代理事务所（普通合伙） | 代理人 | 陈宏升 |
| 地址 | 510000广东省广州市黄埔区广州国际生物岛螺旋四路9号第二层C201单元 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基因测序数据重组封装的方法，包括如下步骤，步骤1：构建参考基因组数据库和基因字典；步骤2：获取样品中染色体的第二基因序列；步骤3：将步骤2的第二基因序列和多条第一基因序列进行比对；步骤4：将第二基因序列和标准基因进行比对；步骤5：将基因片段中的核苷酸以N个为一组依次进行分组；步骤6：将前段、基因片段、后段用基因字典中的代号表示，形成一组核苷酸数据；步骤7：将不同染色体上的核苷酸数据进行统计并压缩即可得到压缩后的基因组数据；步骤8：还原得到样品的第二基因序列。本发明将一小段核苷酸采用字典代码化，能够实现数据的有效压缩；同时，本发明还提供基于该方法的装置。 |
