一种基于Nanopore测序的m6A分析方法
基本信息
| 申请号 | CN202110418078.5 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113130006A | 公开（公告）日 | 2021-07-16 |
| 申请公布号 | CN113130006A | 申请公布日 | 2021-07-16 |
| 分类号 | G16B20/30（2019.01）I;G16B5/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 郑洪坤;聂佩瑶;刘敏;张雪川 | 申请（专利权）人 | 北京百迈客生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京路浩知识产权代理有限公司 | 代理人 | 张璐 |
| 地址 | 101300北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及表观遗传学领域，具体涉及一种基于Nanopore测序的m6A分析方法。所述分析方法可鉴定4种模式（AGACT、GGACA、GGACC、GGACT）下的m6A位点，可以检测CLIP无法检测到的m6A位点，且有较高的准确率。基于鉴定得到的m6A位点，分析m6A位点在mRNA功能元件上的分布以说明其分布的偏好，分析m6A位点甲基化水平的分布以说明其模式偏好，分析转录本水平的甲基化水平分析，可以结合mRNA表达研究其表达偏好。同时，基于鉴定得到的m6A位点，可以分析不同处理样本之间的差异m6A情况。 |
