一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法
基本信息
| 申请号 | CN201910917673.6 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112562783A | 公开（公告）日 | 2021-03-26 |
| 申请公布号 | CN112562783A | 申请公布日 | 2021-03-26 |
| 分类号 | G16B15/00(2019.01)I;G16B25/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 郑洪坤;刘福*;刘敏;李绪明;王晶;梁若冰 | 申请（专利权）人 | 北京百迈客生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京路浩知识产权代理有限公司 | 代理人 | 商秀玲 |
| 地址 | 101300北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢5层508室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及生物信息技术领域，具体涉及一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法。本发明提供一种基因组三维结构差异的鉴定方法，包括在Hi‑C数据的基础上进行差异AB Compartment的鉴定、差异TAD的鉴定和差异Loop的鉴定，利用该方法可实现利用原位Hi‑C数据对动植物进行不同层级的基因组三维结构差异的高效鉴定。本发明提供利用该基因组三维结构差异鉴定方法联合转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法，利用该联合分析方法可实现从基因组三维结构与转录组两个层面进行差异分析，进而实现对动植物功能基因的高效挖掘。 |
