用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法

基本信息

申请号 CN202110312522.5 申请日 -
公开(公告)号 CN112853503A 公开(公告)日 2021-05-28
申请公布号 CN112853503A 申请公布日 2021-05-28
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I 分类 -
发明人 郑洪坤;刘敏;陈钰萌;张梦龙 申请(专利权)人 北京百迈客生物科技有限公司
代理机构 北京路浩知识产权代理有限公司 代理人 商秀玲
地址 101300北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及单细胞测序技术领域,具体涉及用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法。本发明提供的文库构建方法包括:将单细胞或微量样本裂解后,采用Smart‑seq2方法将mRNA反转录制备cDNA,以所述cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行FFPE和末端修复,再连接纳米孔测序接头。该方法可以实现真正的单细胞测序,且兼具转录本覆盖度高、分辨率高、灵活性强的优点,可应用于单细胞的差异基因表达分析、转录本结构分析、全长isoform鉴定等。