一种纳米孔全长转录组文库构建方法
基本信息
申请号 | CN202110313236.0 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN113046416A | 公开(公告)日 | 2021-06-29 |
申请公布号 | CN113046416A | 申请公布日 | 2021-06-29 |
分类号 | C12Q1/6806(2018.01)I;C12N15/10(2006.01)I;C40B50/06(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 郑洪坤;刘敏;张梦龙;陈钰萌;骆晨;赵国瑞 | 申请(专利权)人 | 北京百迈客生物科技有限公司 |
代理机构 | 北京路浩知识产权代理有限公司 | 代理人 | 商秀玲 |
地址 | 101300北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明涉及转录组测序技术领域,具体涉及一种纳米孔全长转录组文库构建方法。本发明的文库构建方法包括:将mRNA富集后,采用SMART技术将mRNA反转录制备cDNA,以cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行FFPE和末端修复,再连接纳米孔测序接头。该方法利用SMART技术构建全长转录组文库,文库可用于纳米孔测序,对于读长没有上限的限制,不需要进行长度选择,无需拼接,整个转录本可以进行单读长的端到端测序,可实现简单、准确的组装,并能区分高度相似的异构体、识别新转录本以及检测融合。 |
