一种三代全长转录组辅助基因预测的方法

基本信息

申请号 CN202110322129.4 申请日 -
公开(公告)号 CN113077842A 公开(公告)日 2021-07-06
申请公布号 CN113077842A 申请公布日 2021-07-06
分类号 G16B20/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分类 物理
发明人 郑洪坤;刘福*;李绪明;李婧姬;王晶 申请(专利权)人 北京百迈客生物科技有限公司
代理机构 北京路浩知识产权代理有限公司 代理人 钱云
地址 101300北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及生物信息技术领域,具体涉及一种三代全长转录组辅助基因预测的方法。本发明所述方法包括利用同源物种的基因信息和二代转录组数据信息获取待预测物种基因组高可靠内含子剪切位点;利用所述高可靠内含子剪切位点,对三代全长转录组测序数据预测的内含子剪切位点进行自动化纠正,获取高可靠性转录本后进行基因结构预测。本发明所述方法可实现可变剪接的预测,从而利用三代全长转录组数据对动植物基因组的基因结构在全基因组水平上进行高准确性的预测。